Was ihr da vorschlagt ist sehr ungewöhnlich. Normalerweise wird RTH immer als FS des FC programmiert, denn ohne Zusammenarbeit mit diesem ist RTH auch gar nicht möglich. Der Empfänger wird üblicherweise so eingestellt, dass er keine Signale mehr ausgibt, was der FC dann wiederum erkennt und RTH aktiviert. Mir ist jedenfalls kein Pilot bekannt, der den RTH Kanal per vordefiniertem Signal durch den RX ansteuert bei Empfangsverlust. Das wäre meiner Meinung nach auch viel zu riskant.
Allerdings ist Cleanflight eher ungeeignet für solche GPS Spielchen, da das GPS dort einfach nur mittelprächtig funktioniert. Selbst programmieren würde ich da sowieso lassen. Lieber, wie schon erwähnt, einen Request erstellen und hoffen, dass es irgendwann in die offizielle Version einfließt.